La Direzione del MuDA è affidata a un comitato scientifico, la cui attività è regolata da una Convenzione Quadro tra il Comune di Albissola Marina e il Dipartimento di Italianistica, Romanistica, Antichistica, Arti e Spettacolo (DIRAAS) dell'Università di Genova.

Composizione del comitato scientifico:

ALBERTO BENISCELLI
Professore ordinario di Letteratura italiana, Direttore DIRAAS, Università di Genova

LUCA BOCHICCHIO
Dottore di ricerca, Archivio d'Arte Contemporanea, Università di Genova

ENRICO CRISPOLTI
Professore ordinario emerito di Storia dell'arte contemporanea, Università di Siena

LEO LECCI
Ricercatore di Storia dell'arte contemporanea, Direttore Archivio d'Arte Contemporanea, Università di Genova
Referente scientifico MuDA

LAURO MAGNANI
Professore ordinario di Storia dell'arte moderna, Università di Genova

ANTONIO SGAMELLOTTI
Accademico dei Lincei - Professore ordinario di Chimica inorganica - CNR - Università di Perugia

PAOLA VALENTI
Ricercatrice di Storia dell'arte contemporanea, Università di Genova

FEDERICO ZANONER
Storico dell'arte - Archivi del '900 Mart Rovereto